引起船舶柴油机故障的原因是多方面的。有设计结构和选材不当引起的，也有加工制造和装配、调试质量欠佳引起的，也有使用操作不当和维护保养不良引起的。在这里主要对操作维护保养及加工制造等方面造成故障的原因予以简单介绍。
1. 操作方面的原因：
由于违章操作造成的船舶柴油机故障，在船舶柴油机故障中占有很大比例。这其中有思想上的疏忽，技术上的不熟悉，也有错误的习惯作法。
常见的违章操作有以下几个方面：
⑴起动时间过长。
⑵冷车起动不经过暖车便快速加大负荷运转。
⑶磨合不充分，便高负荷运行。
⑷带负荷急停车。
⑸油面不足开车。
⑹水面不足开车。
⑺超负荷或者超速运转。
⑻水温油温不正常而继续运行。
⑼高速、高负荷运转中急停车。